Nepaprastų DNR turinčių bakteriofagų nepavyko aptikti standartiniais metodais - tačiau dabar mokslininkai mano, kad jie dominuoja pasaulio vandenynuose.
Kiekviename ne per giliai nuo jūros paviršiaus esančiame vandens laše yra apie 10 milijonų virusų. Vargu ar stebina tai, kad biologai nuolat atranda naujų, nors visiškai naujos grupės atradimas vis dar labai retas. Atrodo, kad standartiniai metodai tiesiog neleido jų pastebėti, nors tokių virusų pasirodė be galo daug - galbūt jie paplitę ne tik vandenyne ir tiesiog paslėpti mokslininkai.
- „Salik.biz“
Martinas Polzas iš Masačusetso technologijos instituto ir jo kolegos ištyrė vandens mėginius, paimtus iš Šiaurės Amerikos Atlanto vandenyno krantų. Jie ieškojo virusų, turinčių dvigrandinę DNR - tokie virusai yra labai paplitę, įskaitant herpesą, ir bakteriofagas T4 (Caudovirales), visiems pažįstamas iš mokyklos. Užkrėsdami jūrinių bakterijų Vibrionaceae kultūras, mokslininkai atrado 200 skirtingų DNR virusų, iš kurių 18 buvo priskirti naujai tvarkai Autolykiviridae. Apie tai jie rašo žurnale „Nature“paskelbtame straipsnyje.
Grupės vardas nurodo graikų mitologijos herojų Autolycus - klastingą vagį, kurį taip sunku pagauti kaip šiuos virusus. „Dažniausi virusai Žemėje yra bakterijomis užkrėsti virusai, turintys dvigubos grandinės DNR“, - rašo Poltzas ir jo bendraautoriai. „Tačiau Caudovirales su uodegos virusais, kurie dominuoja pasėlių duomenų bazėse ir kolekcijose, neatspindi jų buvimo aplinkoje. Tiesą sakant, vandens mėginiuose dominuoja bekvapiai virusai “.
Bakterijų ląstelės, užkrėstos Autolykiviridae / MIT fagais, Kauffman ir kt., 2018 m.
„Nesudėtingi“bakteriofagai Autolykiviridae išsiskiria mažu genomo dydžiu - tik apie 10 tūkstančių bazių, 4-5 kartus mažiau nei „uodeginiuose“giminaičiuose. Jų gebėjimas užkrėsti ir užmušti bakterijų ląsteles taip pat buvo neįprastas. Jei paprasti fagai eksperimentuose paprastai paveikė vieną konkrečią rūšių vibriją, šie užkrėsti vidutiniškai keturiomis ir lėmė pastebimai didesnę ląstelių mirtį. „Buvo nustatyta, kad jie sukelia 40 procentų bakterijų mirčių, nors jie sudarė apie 10 procentų visų mėginių virusų“, - aiškina vienas iš darbo autorių.
Įvairių rūšių vibrio bakterijos išsidėsčiusios išilgai diagramos perimetro, su jomis susieti virusus užkrečiantys virusai: mėlyni - „uodegos“bakteriofagai, oranžiniai - „uodegos“Autolykiviridae / MIT, Kauffman ir kt., 2018 m.
Šie skaičiai rodo didelį vaidmenį, kurį vaidina naujoji grupė Autolykiviridae, reguliuojant bakterijų populiacijas ir visą biosferą. Mokslininkai įsitikinę, kad jų technika padės rasti virusus, kurių anksčiau nepavyko aptikti dirvožemyje ir galbūt žmogaus žarnyne. Panašios genetinės sekos iš tiesų yra žmogaus mikrofloros bakterijų genomuose.
Reklaminis vaizdo įrašas:
Sergejus Vasiljevas