Manoma, kad pirmasis žinomas kriptografijos pritaikymas yra specialių hieroglifų naudojimas maždaug prieš 4000 metų Senovės Egipte. Kriptografijos elementai buvo rasti jau Senųjų ir Vidurinių karalysčių užrašuose, visiškai kriptografiniai tekstai buvo žinomi nuo XVIII dinastijos laikotarpio. Hieroglifinis rašymas, gautas iš piktografijos, buvo pripildytas ideogramų ir dėl nepakankamo vokalizacijos leido kurti fonogramas pagal galvosūkius.
Egiptiečių kriptografija buvo naudojama ne tam, kad būtų sunku skaityti, o veikiau - raštininkų noras aplenkti vienas kitą sąmojingumu ir išradingumu, taip pat, pasitelkiant neįprastumą ir paslaptingumą, atkreipti dėmesį į jų tekstus. Vienas iš aiškinamųjų pavyzdžių yra didiko Khnumhotepo II (XIX a. Pr. Kr.) Šlovinimo tekstai, rasti gerai išsaugotame antkapyje Nr. BH 3 Beni Hasano srityje.
- „Salik.biz“
Senovės egiptiečiai naudojo mažiausiai tris šifravimo sistemas.
Senovės Indijos tekstuose iš 64 menų įvardijami teksto keitimo būdai, kai kuriuos iš jų galima priskirti kriptografiniams. Mesopotamijos keramikos glazūros gamybos recepto autorius naudojo retus pavadinimus, praleido raides ir vardus pakeitė skaičiais, kad paslėptų, kas buvo parašyta. Ateityje bus įvairių nuorodų apie kriptografijos naudojimą, dauguma jų susijusios su naudojimu kariniuose reikaluose.
Atsiradus fonetiniam rašymui, rašymas buvo nedelsiant supaprastintas. Senovės semitų abėcėlėje II tūkstantmetyje pr. Kr. Buvo tik apie 30 ženklų. Jie žymėjo priebalsius, taip pat kai kuriuos balsių garsus ir skiemenis. Rašymo supaprastinimas paskatino kriptografijos ir šifravimo plėtrą.
Kriptografijos naudojimo pavyzdžių galima rasti šventose žydų knygose, įskaitant pranašo Jeremijo knygą (VI a. Pr. Kr.), Kur buvo naudojamas paprastas šifravimo metodas, vadinamas atbash. Vietoj pirmosios abėcėlės raidės jie rašė paskutinę, vietoje antrosios - priešpaskutinę ir t.
Vienas seniausių žinomų kriptografinių prietaisų yra skitala, dar vadinamas „senovės Sparta šifru“. „Skitala“(arba „scitala“iš graikų k. Σκυτάλη, lazdelė) yra prietaisas, naudojamas permutacijos šifravimui atlikti. Skitala buvo sudaryta iš cilindro ir siauros pergamento juostelės, apvyniotos aplink ją spirale, ant kurios buvo užrašytas pranešimas. Šį prietaisą išrado spartiečiai ir yra žinoma, kad jis buvo naudojamas Sparta kare prieš Atėnus 5-ojo amžiaus pabaigoje prieš Kristų. e.